Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudcd1Q6PIP5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms