Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ecm29Q6PDI5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ecm29Q6PDI5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms