Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE7

Ggt6, Glutathione hydrolase 6, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggt6Q6PDE7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ggt6Q6PDE7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggt6Q6PDE7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms