Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms