Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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