Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf8Q6DID3 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms