Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptbn2Q68FG2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms