Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clcn1Q64347 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms