Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PatjQ63ZW7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PatjQ63ZW7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PatjQ63ZW7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms