Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms