Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5dQ62240 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms