Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sycp1Q62209 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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