Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Mre11Q61216 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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