Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Samhd1Q60710 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms