Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm1Q60636 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms