Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms