Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tns3Q5SSZ5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tns3Q5SSZ5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms