Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim41Q5NCC3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim41Q5NCC3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms