Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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