Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Fam220aQ3ZN08 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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