Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC051142Q3V0M8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms