Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp48Q3V0C5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp48Q3V0C5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp48Q3V0C5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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