Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm29609Q3UU56 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms