Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fchsd2Q3USJ8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms