Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms