Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms