Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms