Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q3U595 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U595 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Q3U595 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U595 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U595 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U595 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms