Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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