Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms