Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms