Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms