Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc10Q3TLI0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms