Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc13Q3TIR1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms