Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms