Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms