Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms