Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms