Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp2Q06649 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms