Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prrx2Q06348 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms