Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms