Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col1a2Q01149 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms