Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms