Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms