Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gfra1P97785 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfra1P97785 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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