Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms