Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pkp1P97350 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp1P97350 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms