Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tubg1P83887 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms