Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabpb2P81069 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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