Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9xP70398 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms